Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PCGF2P35227 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCGF2P35227 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms