Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6P35125 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6P35125 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6P35125 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6P35125 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6P35125 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6P35125 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP6P35125 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP6P35125 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP6P35125 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP6P35125 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP6P35125 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
USP6P35125 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6P35125 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6P35125 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6P35125 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6P35125 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6P35125 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms