Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LINC00879-205ENST00000470465 757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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