Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP1P29466 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP1P29466 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP1P29466 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP1P29466 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP1P29466 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP1P29466 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms