Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAP3P28838 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAP3P28838 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAP3P28838 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAP3P28838 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAP3P28838 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAP3P28838 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAP3P28838 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAP3P28838 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAP3P28838 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAP3P28838 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms