Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PLNP26678 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PLNP26678 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PLNP26678 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PLNP26678 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PLNP26678 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms