Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4BP23588 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms