Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2P10911 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2P10911 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2P10911 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCF2P10911 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCF2P10911 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCF2P10911 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCF2P10911 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCF2P10911 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCF2P10911 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCF2P10911 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCF2P10911 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCF2P10911 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCF2P10911 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCF2P10911 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCF2P10911 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms