Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL1O95922 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms