Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEBLO76041 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEBLO76041 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEBLO76041 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEBLO76041 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEBLO76041 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEBLO76041 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEBLO76041 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEBLO76041 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms