Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP9O75884 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms