Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GMDSO60547 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GMDSO60547 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GMDSO60547 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms