Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHOX2AO14813 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms