Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms