Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC5DA1L4H1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC5DA1L4H1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms