Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYCE3A1L190 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCE3A1L190 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms