Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
V9GYH0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
V9GYH0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYH0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
V9GYH0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYH0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
V9GYH0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYH0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYH0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYH0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
V9GYH0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYH0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
V9GYH0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYH0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYH0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
V9GYH0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
V9GYH0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
V9GYH0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYH0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYH0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
V9GYH0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYH0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYH0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
V9GYH0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYH0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYH0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYH0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
V9GYH0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYH0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYH0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
V9GYH0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
V9GYH0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
V9GYH0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
V9GYH0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
V9GYH0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
V9GYH0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GYH0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GYH0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GYH0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GYH0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYH0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYH0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYH0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GYH0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYH0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYH0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYH0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYH0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
V9GYH0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYH0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYH0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYH0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
V9GYH0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
V9GYH0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYH0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYH0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYH0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYH0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYH0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYH0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYH0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYH0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYH0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYH0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYH0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYH0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYH0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYH0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYH0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYH0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYH0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYH0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYH0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYH0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYH0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYH0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYH0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GYH0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GYH0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GYH0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
V9GYH0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
V9GYH0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
V9GYH0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GYH0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GYH0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
V9GYH0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
V9GYH0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
V9GYH0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms