Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USH1CQ9Y6N9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USH1CQ9Y6N9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USH1CQ9Y6N9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USH1CQ9Y6N9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USH1CQ9Y6N9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USH1CQ9Y6N9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USH1CQ9Y6N9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms