Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3AQ9Y6K1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DNMT3AQ9Y6K1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT3AQ9Y6K1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNMT3AQ9Y6K1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT3AQ9Y6K1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms