Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD54BQ9Y620 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD54BQ9Y620 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RAD54BQ9Y620 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD54BQ9Y620 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54BQ9Y620 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD54BQ9Y620 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms