Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCDHB2Q9Y5E7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB2Q9Y5E7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB2Q9Y5E7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms