Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NFE2L3Q9Y4A8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NFE2L3Q9Y4A8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFE2L3Q9Y4A8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFE2L3Q9Y4A8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFE2L3Q9Y4A8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
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