Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR2E1Q9Y466 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E1Q9Y466 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR2E1Q9Y466 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR2E1Q9Y466 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NR2E1Q9Y466 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms