Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF11Q9Y3C5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF11Q9Y3C5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF11Q9Y3C5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF11Q9Y3C5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF11Q9Y3C5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF11Q9Y3C5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms