Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVW-1Q9UQF0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVW-1Q9UQF0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVW-1Q9UQF0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVW-1Q9UQF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVW-1Q9UQF0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms