Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SHANK2Q9UPX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SHANK2Q9UPX8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
SHANK2Q9UPX8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
SHANK2Q9UPX8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.72■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SHANK2Q9UPX8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SHANK2Q9UPX8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SHANK2Q9UPX8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHANK2Q9UPX8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHANK2Q9UPX8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
SHANK2Q9UPX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SHANK2Q9UPX8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
SHANK2Q9UPX8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SHANK2Q9UPX8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms