Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AGAP1Q9UPQ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AGAP1Q9UPQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
AGAP1Q9UPQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGAP1Q9UPQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGAP1Q9UPQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGAP1Q9UPQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AGAP1Q9UPQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AGAP1Q9UPQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms