Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PHF8Q9UPP1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PHF8Q9UPP1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PHF8Q9UPP1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PHF8Q9UPP1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PHF8Q9UPP1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PHF8Q9UPP1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PHF8Q9UPP1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PHF8Q9UPP1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PHF8Q9UPP1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PHF8Q9UPP1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PHF8Q9UPP1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms