Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX6Q9UPM6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX6Q9UPM6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX6Q9UPM6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX6Q9UPM6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX6Q9UPM6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LHX6Q9UPM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX6Q9UPM6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189 ms