Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
L1RE1Q9UN81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
L1RE1Q9UN81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
L1RE1Q9UN81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
L1RE1Q9UN81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
L1RE1Q9UN81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1RE1Q9UN81 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms