Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLEC4EQ9ULY5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLEC4EQ9ULY5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLEC4EQ9ULY5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLEC4EQ9ULY5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLEC4EQ9ULY5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLEC4EQ9ULY5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms