Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PADI3Q9ULW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI3Q9ULW8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI3Q9ULW8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI3Q9ULW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PADI3Q9ULW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PADI3Q9ULW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PADI3Q9ULW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms