Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KCNH3Q9ULD8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KCNH3Q9ULD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KCNH3Q9ULD8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNH3Q9ULD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNH3Q9ULD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNH3Q9ULD8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNH3Q9ULD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms