Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARRES3Q9UL19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RARRES3Q9UL19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARRES3Q9UL19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARRES3Q9UL19 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RARRES3Q9UL19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms