Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACSIN3Q9UKS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3Q9UKS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3Q9UKS6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3Q9UKS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3Q9UKS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms