Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
AKAP11Q9UKA4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
AKAP11Q9UKA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
AKAP11Q9UKA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
AKAP11Q9UKA4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
AKAP11Q9UKA4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
AKAP11Q9UKA4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
AKAP11Q9UKA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AKAP11Q9UKA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 614.9 ms