Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPUSD1Q9UJJ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms