Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDH22Q9UJ99 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH22Q9UJ99 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH22Q9UJ99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDH22Q9UJ99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH22Q9UJ99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH22Q9UJ99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms