Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLCO3A1Q9UIG8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLCO3A1Q9UIG8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLCO3A1Q9UIG8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLCO3A1Q9UIG8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLCO3A1Q9UIG8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLCO3A1Q9UIG8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLCO3A1Q9UIG8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLCO3A1Q9UIG8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLCO3A1Q9UIG8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms