Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHQ4

BCAP29, B-cell receptor-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAP29Q9UHQ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAP29Q9UHQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAP29Q9UHQ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAP29Q9UHQ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCAP29Q9UHQ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCAP29Q9UHQ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAP29Q9UHQ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAP29Q9UHQ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCAP29Q9UHQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCAP29Q9UHQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCAP29Q9UHQ4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCAP29Q9UHQ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms