Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTRF1LQ9UGC7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRF1LQ9UGC7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MTRF1LQ9UGC7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTRF1LQ9UGC7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTRF1LQ9UGC7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTRF1LQ9UGC7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTRF1LQ9UGC7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTRF1LQ9UGC7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTRF1LQ9UGC7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTRF1LQ9UGC7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms