Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DNMT3BQ9UBC3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DNMT3BQ9UBC3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNMT3BQ9UBC3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNMT3BQ9UBC3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNMT3BQ9UBC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms