Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2P5

HECW2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, humanhuman

Predictions only

Length 1,572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW2Q9P2P5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
HECW2Q9P2P5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
HECW2Q9P2P5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
HECW2Q9P2P5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
HECW2Q9P2P5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
HECW2Q9P2P5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.08
HECW2Q9P2P5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
HECW2Q9P2P5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HECW2Q9P2P5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
HECW2Q9P2P5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
HECW2Q9P2P5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
HECW2Q9P2P5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
HECW2Q9P2P5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
HECW2Q9P2P5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
HECW2Q9P2P5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
HECW2Q9P2P5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
HECW2Q9P2P5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
HECW2Q9P2P5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
HECW2Q9P2P5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
HECW2Q9P2P5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
HECW2Q9P2P5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW2Q9P2P5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW2Q9P2P5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
HECW2Q9P2P5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms