Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL9Q9P2J3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL9Q9P2J3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL9Q9P2J3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL9Q9P2J3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL9Q9P2J3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms