Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H3

IFT80, Intraflagellar transport protein 80 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT80Q9P2H3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT80Q9P2H3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT80Q9P2H3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT80Q9P2H3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT80Q9P2H3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT80Q9P2H3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT80Q9P2H3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms