Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFY2Q9P0M6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFY2Q9P0M6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFY2Q9P0M6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFY2Q9P0M6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2AFY2Q9P0M6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms