Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN3Q9NZ94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLGN3Q9NZ94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NLGN3Q9NZ94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLGN3Q9NZ94 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLGN3Q9NZ94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms