Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ72

STMN3, Stathmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN3Q9NZ72 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STMN3Q9NZ72 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STMN3Q9NZ72 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STMN3Q9NZ72 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STMN3Q9NZ72 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STMN3Q9NZ72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STMN3Q9NZ72 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STMN3Q9NZ72 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN3Q9NZ72 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN3Q9NZ72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms