Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBAP1Q9NZ09 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBAP1Q9NZ09 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBAP1Q9NZ09 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBAP1Q9NZ09 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP1Q9NZ09 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms