Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ3

GTSE1, G2 and S phase-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1Q9NYZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTSE1Q9NYZ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GTSE1Q9NYZ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GTSE1Q9NYZ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTSE1Q9NYZ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTSE1Q9NYZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTSE1Q9NYZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTSE1Q9NYZ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTSE1Q9NYZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTSE1Q9NYZ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTSE1Q9NYZ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1016.8 ms